Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf5P43027 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdf5P43027 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf5P43027 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms