Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec3bP43025 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms