Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HttP42859 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HttP42859 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HttP42859 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HttP42859 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HttP42859 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HttP42859 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HttP42859 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HttP42859 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HttP42859 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HttP42859 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HttP42859 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HttP42859 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HttP42859 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HttP42859 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HttP42859 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HttP42859 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HttP42859 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HttP42859 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HttP42859 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HttP42859 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HttP42859 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HttP42859 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HttP42859 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HttP42859 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HttP42859 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HttP42859 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HttP42859 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HttP42859 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HttP42859 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HttP42859 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HttP42859 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HttP42859 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HttP42859 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HttP42859 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HttP42859 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HttP42859 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HttP42859 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HttP42859 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HttP42859 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HttP42859 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HttP42859 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HttP42859 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HttP42859 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HttP42859 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HttP42859 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HttP42859 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HttP42859 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HttP42859 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HttP42859 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HttP42859 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HttP42859 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HttP42859 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HttP42859 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HttP42859 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HttP42859 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HttP42859 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HttP42859 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HttP42859 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HttP42859 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HttP42859 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HttP42859 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HttP42859 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HttP42859 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HttP42859 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HttP42859 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HttP42859 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HttP42859 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HttP42859 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HttP42859 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HttP42859 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HttP42859 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HttP42859 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HttP42859 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HttP42859 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HttP42859 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HttP42859 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HttP42859 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HttP42859 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HttP42859 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HttP42859 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HttP42859 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HttP42859 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HttP42859 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HttP42859 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HttP42859 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HttP42859 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HttP42859 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HttP42859 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HttP42859 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HttP42859 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms