Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnfsf9P41274 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf9P41274 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf9P41274 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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