Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Etv1P41164 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Etv1P41164 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Etv1P41164 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Etv1P41164 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv1P41164 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv1P41164 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv1P41164 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Etv1P41164 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Etv1P41164 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Etv1P41164 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Etv1P41164 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms