Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cap1P40124 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cap1P40124 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cap1P40124 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cap1P40124 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cap1P40124 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cap1P40124 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cap1P40124 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cap1P40124 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cap1P40124 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cap1P40124 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cap1P40124 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cap1P40124 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cap1P40124 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cap1P40124 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cap1P40124 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cap1P40124 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cap1P40124 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cap1P40124 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cap1P40124 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms