Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf2P39429 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf2P39429 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf2P39429 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Traf2P39429 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf2P39429 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf2P39429 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf2P39429 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf2P39429 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms