Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Traf1P39428 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf1P39428 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Traf1P39428 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf1P39428 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf1P39428 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf1P39428 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf1P39428 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf1P39428 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf1P39428 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms