Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpardP35396 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpardP35396 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpardP35396 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpardP35396 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpardP35396 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpardP35396 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PpardP35396 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpardP35396 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpardP35396 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PpardP35396 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PpardP35396 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PpardP35396 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PpardP35396 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PpardP35396 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PpardP35396 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpardP35396 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpardP35396 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpardP35396 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpardP35396 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpardP35396 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpardP35396 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpardP35396 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpardP35396 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PpardP35396 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpardP35396 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpardP35396 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpardP35396 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpardP35396 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpardP35396 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpardP35396 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpardP35396 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpardP35396 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PpardP35396 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PpardP35396 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PpardP35396 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PpardP35396 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PpardP35396 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PpardP35396 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PpardP35396 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PpardP35396 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpardP35396 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpardP35396 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpardP35396 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpardP35396 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpardP35396 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpardP35396 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpardP35396 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpardP35396 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpardP35396 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PpardP35396 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PpardP35396 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PpardP35396 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PpardP35396 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PpardP35396 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PpardP35396 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PpardP35396 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PpardP35396 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PpardP35396 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PpardP35396 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PpardP35396 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PpardP35396 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PpardP35396 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PpardP35396 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpardP35396 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpardP35396 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpardP35396 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpardP35396 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpardP35396 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpardP35396 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpardP35396 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpardP35396 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpardP35396 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpardP35396 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PpardP35396 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PpardP35396 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PpardP35396 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PpardP35396 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PpardP35396 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PpardP35396 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PpardP35396 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PpardP35396 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PpardP35396 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PpardP35396 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PpardP35396 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PpardP35396 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PpardP35396 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms