Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab17P35292 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab17P35292 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab17P35292 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab17P35292 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab17P35292 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab17P35292 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms