Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab23P35288 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab23P35288 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab23P35288 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab23P35288 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab23P35288 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab23P35288 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab23P35288 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab23P35288 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab23P35288 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab23P35288 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms