Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tfap2aP34056 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2aP34056 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2aP34056 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms