Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoc3P33622 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms