Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola2P33611 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola2P33611 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola2P33611 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola2P33611 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pola2P33611 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola2P33611 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola2P33611 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola2P33611 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola2P33611 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola2P33611 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola2P33611 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola2P33611 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms