Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh15P33146 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh15P33146 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh15P33146 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh15P33146 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms