Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cbx2P30658 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx2P30658 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms