Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha3P29319 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epha3P29319 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epha3P29319 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha3P29319 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha3P29319 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha3P29319 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epha3P29319 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms