Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Marcksl1P28667 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms