Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col2a1P28481 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col2a1P28481 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col2a1P28481 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms