Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja4P28235 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja4P28235 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja4P28235 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja4P28235 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja4P28235 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja4P28235 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja4P28235 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja4P28235 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja4P28235 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms