Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gjb1P28230 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gjb1P28230 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb1P28230 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms