Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CenpbP27790 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CenpbP27790 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CenpbP27790 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CenpbP27790 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CenpbP27790 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CenpbP27790 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CenpbP27790 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CenpbP27790 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CenpbP27790 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CenpbP27790 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms