Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rpl3P27659 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl3P27659 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl3P27659 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms