Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gabra3P26049 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabra3P26049 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra3P26049 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra3P26049 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra3P26049 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra3P26049 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra3P26049 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra3P26049 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms