Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra2P26048 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra2P26048 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra2P26048 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms