Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Eif3aP23116 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Eif3aP23116 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Eif3aP23116 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Eif3aP23116 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms