Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RarbP22605 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RarbP22605 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RarbP22605 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RarbP22605 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RarbP22605 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RarbP22605 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RarbP22605 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RarbP22605 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RarbP22605 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RarbP22605 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RarbP22605 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RarbP22605 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RarbP22605 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RarbP22605 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RarbP22605 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RarbP22605 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RarbP22605 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RarbP22605 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RarbP22605 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RarbP22605 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RarbP22605 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RarbP22605 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RarbP22605 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RarbP22605 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RarbP22605 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RarbP22605 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RarbP22605 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RarbP22605 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RarbP22605 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RarbP22605 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RarbP22605 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RarbP22605 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RarbP22605 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RarbP22605 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RarbP22605 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RarbP22605 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RarbP22605 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RarbP22605 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RarbP22605 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RarbP22605 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RarbP22605 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RarbP22605 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RarbP22605 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RarbP22605 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RarbP22605 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RarbP22605 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RarbP22605 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RarbP22605 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RarbP22605 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RarbP22605 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RarbP22605 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RarbP22605 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RarbP22605 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RarbP22605 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RarbP22605 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RarbP22605 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RarbP22605 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RarbP22605 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RarbP22605 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RarbP22605 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RarbP22605 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RarbP22605 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RarbP22605 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RarbP22605 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RarbP22605 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RarbP22605 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RarbP22605 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RarbP22605 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RarbP22605 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RarbP22605 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RarbP22605 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RarbP22605 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RarbP22605 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RarbP22605 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RarbP22605 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RarbP22605 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RarbP22605 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RarbP22605 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RarbP22605 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms