Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gadd45bP22339 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gadd45bP22339 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gadd45bP22339 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gadd45bP22339 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gadd45bP22339 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gadd45bP22339 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gadd45bP22339 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gadd45bP22339 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gadd45bP22339 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gadd45bP22339 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45bP22339 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms