Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc2P20801 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnc2P20801 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc2P20801 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms