Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfaP20033 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfaP20033 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfaP20033 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfaP20033 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfaP20033 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PdgfaP20033 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfaP20033 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfaP20033 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PdgfaP20033 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PdgfaP20033 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfaP20033 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PdgfaP20033 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdgfaP20033 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms