Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka3P18654 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka3P18654 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka3P18654 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms