Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkceP16054 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkceP16054 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkceP16054 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkceP16054 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkceP16054 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkceP16054 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkceP16054 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms