Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd44P15379 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd44P15379 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd44P15379 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd44P15379 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd44P15379 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd44P15379 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd44P15379 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd44P15379 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd44P15379 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd44P15379 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms