Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RaraP11416 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RaraP11416 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RaraP11416 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RaraP11416 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RaraP11416 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RaraP11416 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RaraP11416 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RaraP11416 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaraP11416 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RaraP11416 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RaraP11416 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RaraP11416 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RaraP11416 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RaraP11416 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RaraP11416 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RaraP11416 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RaraP11416 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RaraP11416 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RaraP11416 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RaraP11416 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RaraP11416 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RaraP11416 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RaraP11416 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RaraP11416 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RaraP11416 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RaraP11416 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RaraP11416 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RaraP11416 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RaraP11416 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RaraP11416 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RaraP11416 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RaraP11416 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RaraP11416 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RaraP11416 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaraP11416 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaraP11416 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaraP11416 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RaraP11416 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaraP11416 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaraP11416 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RaraP11416 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaraP11416 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaraP11416 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaraP11416 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RaraP11416 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaraP11416 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaraP11416 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaraP11416 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaraP11416 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaraP11416 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaraP11416 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaraP11416 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaraP11416 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaraP11416 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaraP11416 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaraP11416 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaraP11416 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RaraP11416 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RaraP11416 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RaraP11416 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RaraP11416 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RaraP11416 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RaraP11416 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RaraP11416 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RaraP11416 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RaraP11416 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaraP11416 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RaraP11416 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaraP11416 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaraP11416 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaraP11416 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaraP11416 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RaraP11416 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RaraP11416 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RaraP11416 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RaraP11416 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RaraP11416 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RaraP11416 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms