Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col1a1P11087 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a1P11087 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a1P11087 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms