Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc6P10629 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc6P10629 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc6P10629 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc6P10629 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms