Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP10400 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP10400 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP10400 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP10400 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP10400 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP10400 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP10400 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP10400 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP10400 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP10400 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP10400 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP10400 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP10400 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP10400 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP10400 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP10400 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP10400 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP10400 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP10400 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP10400 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP10400 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP10400 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP10400 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP10400 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP10400 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP10400 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP10400 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP10400 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP10400 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP10400 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP10400 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP10400 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP10400 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP10400 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP10400 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP10400 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP10400 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP10400 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP10400 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP10400 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP10400 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PolP10400 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolP10400 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolP10400 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolP10400 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolP10400 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolP10400 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolP10400 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolP10400 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolP10400 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolP10400 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolP10400 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolP10400 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PolP10400 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolP10400 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolP10400 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolP10400 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolP10400 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolP10400 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolP10400 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolP10400 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolP10400 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolP10400 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP10400 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP10400 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP10400 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP10400 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP10400 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolP10400 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP10400 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms