Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl1P10146 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccl1P10146 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms