Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3cP0DOY1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3cP0DOY1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dnmt3cP0DOY1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms