Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6c1P0CW02 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6c1P0CW02 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms