Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UbbP0CG49 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UbbP0CG49 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms