Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pla2g4bP0C871 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pla2g4bP0C871 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pla2g4bP0C871 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms