Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna9P09235 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna9P09235 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms