Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb1P09055 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb1P09055 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Itgb1P09055 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb1P09055 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms