Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spta1P08032 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spta1P08032 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spta1P08032 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spta1P08032 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spta1P08032 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spta1P08032 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spta1P08032 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Spta1P08032 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spta1P08032 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spta1P08032 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spta1P08032 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms