Protein–RNA interactions for Protein: P06797

Ctsl, Cathepsin L1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtslP06797 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtslP06797 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtslP06797 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtslP06797 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CtslP06797 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtslP06797 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtslP06797 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtslP06797 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtslP06797 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtslP06797 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CtslP06797 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtslP06797 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtslP06797 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtslP06797 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtslP06797 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtslP06797 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CtslP06797 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtslP06797 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtslP06797 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtslP06797 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtslP06797 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtslP06797 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtslP06797 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtslP06797 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CtslP06797 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtslP06797 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtslP06797 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtslP06797 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtslP06797 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtslP06797 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtslP06797 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtslP06797 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtslP06797 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtslP06797 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CtslP06797 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtslP06797 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtslP06797 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtslP06797 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtslP06797 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtslP06797 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CtslP06797 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtslP06797 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtslP06797 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtslP06797 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtslP06797 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtslP06797 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtslP06797 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtslP06797 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtslP06797 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtslP06797 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtslP06797 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtslP06797 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtslP06797 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtslP06797 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CtslP06797 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtslP06797 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtslP06797 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtslP06797 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtslP06797 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtslP06797 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtslP06797 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CtslP06797 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtslP06797 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtslP06797 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtslP06797 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtslP06797 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms