Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrbP05622 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrbP05622 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfrbP05622 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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