Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04214 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P04214 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04214 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04214 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P04214 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04214 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04214 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P04214 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P04214 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P04214 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P04214 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P04214 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P04214 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P04214 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P04214 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P04214 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04214 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04214 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04214 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04214 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04214 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04214 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04214 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P04214 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P04214 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P04214 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04214 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04214 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04214 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P04214 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
P04214 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P04214 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P04214 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04214 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04214 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P04214 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04214 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04214 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04214 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04214 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04214 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04214 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P04214 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04214 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04214 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
P04214 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04214 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04214 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04214 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04214 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04214 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04214 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04214 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04214 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04214 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04214 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04214 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04214 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04214 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04214 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04214 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04214 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04214 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04214 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04214 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04214 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04214 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04214 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04214 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04214 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04214 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04214 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04214 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04214 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04214 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P04214 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04214 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04214 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04214 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04214 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms