Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AfpP02772 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AfpP02772 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AfpP02772 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AfpP02772 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AfpP02772 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AfpP02772 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AfpP02772 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AfpP02772 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AfpP02772 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AfpP02772 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AfpP02772 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AfpP02772 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AfpP02772 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AfpP02772 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AfpP02772 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AfpP02772 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AfpP02772 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AfpP02772 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AfpP02772 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AfpP02772 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AfpP02772 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AfpP02772 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AfpP02772 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AfpP02772 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AfpP02772 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AfpP02772 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AfpP02772 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AfpP02772 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AfpP02772 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AfpP02772 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AfpP02772 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AfpP02772 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AfpP02772 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AfpP02772 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AfpP02772 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AfpP02772 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AfpP02772 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AfpP02772 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AfpP02772 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AfpP02772 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AfpP02772 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AfpP02772 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AfpP02772 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AfpP02772 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AfpP02772 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AfpP02772 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AfpP02772 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AfpP02772 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AfpP02772 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AfpP02772 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AfpP02772 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AfpP02772 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AfpP02772 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AfpP02772 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AfpP02772 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AfpP02772 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AfpP02772 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AfpP02772 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AfpP02772 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AfpP02772 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AfpP02772 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AfpP02772 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AfpP02772 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AfpP02772 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AfpP02772 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AfpP02772 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AfpP02772 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AfpP02772 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AfpP02772 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AfpP02772 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AfpP02772 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AfpP02772 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AfpP02772 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AfpP02772 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AfpP02772 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AfpP02772 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AfpP02772 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AfpP02772 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AfpP02772 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AfpP02772 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms