Protein–RNA interactions for Protein: P02469

Lamb1, Laminin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb1P02469 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb1P02469 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamb1P02469 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lamb1P02469 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamb1P02469 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms